Protein yapı analizinde öncü firmalardan GenNext® Technologies, Inc., bilime hizmet konusunda dünyanın önde gelen şirketlerinden olan Thermo Fisher Scientific ile birlikte biyoterapötik ilaç geliştirme sürecini kolaylaştıracak yeni ve pratik bir yapısal biyoloji iş akışı (workflow) sunmak için iş birliği yaptı.
Bu iş birliği kapsamında, GenNext’in AutoFox® Protein Ayak İzi Analiz Sistemi ile Thermo Fisher’ın alanında lider sıvı kromatografi-kütle spektrometresi (LC-MS) çözümleri —özellikle Thermo Scientific™ Orbitrap™ cihazları, numune hazırlama teknolojileri ve çapraz bağlayıcılar ya da floresan etiketler gibi diğer yapısal proteomik malzemeler— bir araya getirilerek, protein yapısı ve ilaç etkileşimleri üzerine çalışan araştırmacılar için güçlü ve uçtan uca bir çözüm sunuluyor.
Bu entegre sistem, proteinlerin yapısını ve dinamiklerini yüksek çözünürlükte analiz edebiliyor; bu da ilaçların güvenliği, etkinliği ve doğru bir şekilde vücuda ulaştırılması açısından büyük önem taşıyor. Aynı zamanda bu sistem, yapay zeka tarafından geliştirilen yapısal modellerin doğrulanmasında da araştırmacılara önemli bir destek sağlıyor — ki bu alan günümüzde ilaç keşfinde giderek daha fazla öne çıkıyor.
“Thermo Fisher Scientific ile iş birliği yaparak yapısal biyoloji alanında sınırları zorlamaktan büyük heyecan duyuyoruz,” diyor GenNext Technologies CEO’su Scot Weinberger. “Fox® ürün serimizi, Thermo Scientific™ Orbitrap™ Tribrid™ MS veya Thermo Scientific™ Orbitrap Exploris™ MS gibi Thermo Fisher kütle spektrometreleri, ileri seviye reaktifler ve veri analiz yazılımlarıyla entegre ederek, araştırmacıların biyomoleküler yapı ve davranışları şimdiye kadar olmadığı kadar hızlı ve kolay bir şekilde görebilmesini sağlıyoruz.”
Yüksek Çözünürlük, Kolay İş Akışı
İş akışı, GenNext’in AutoFox® sistemiyle başlıyor. Bu sistem, Radikal Protein Ayak İzi Yöntemi (Radical Protein Footprinting) sayesinde proteinlerin şekillerini, esnekliklerini ve bağlanma özelliklerini doğal ortamlarına yakın koşullarda haritalayabiliyor. Elde edilen bu bilgiler, Thermo Fisher’ın Orbitrap kütle spektrometreleriyle yüksek hassasiyet ve doğrulukla analiz ediliyor. Süreci destekleyen EasyPep™ numune hazırlama kitleri ve Tandem Mass Tag reaktifleri, deneylerin tutarlılığını artırıyor, tekrar edilen ölçümlerin birleştirilmesini sağlıyor ve protein kapsama oranını en üst düzeye çıkarıyor. Thermo Scientific™ Orbitrap™ Astral™ kütle spektrometresi de iş akışını daha da ileriye taşıyarak hızlı analiz süresi, yüksek hassasiyet ve geniş kapsamlı protein analiziyle, protein keşfi ve karakterizasyonunu ciddi şekilde hızlandırıyor.
Tüm bu veriler, GenNext’in FoxWare® Yazılımı ve Thermo Scientific’in Proteome Discoverer yazılımıyla işleniyor. Böylece numune hazırlamadan analiz ve sonuçların yorumlanmasına kadar kesintisiz, kolay uygulanabilir ve güçlü bir sistem ortaya çıkıyor. Bu çözüm özellikle biyolojik ilaçlar ve biyobenzerlerin geliştirilmesinde son derece önemli olan yapısal biyoloji araştırmaları için oldukça faydalı bir araç sunuyor.
“Yapısal biyoloji, biyolojik işleyişin moleküler düzeyde anlaşılması ve yeni tedavi yöntemlerinin geliştirilmesi açısından temel bir rol oynuyor,” diyor Thermo Fisher Scientific Yaşam Bilimleri Kütle Spektrometrisi Başkan Yardımcısı ve Genel Müdürü Pushkin Pant. “GenNext ile kurduğumuz bu iş birliği sayesinde, bilim insanları teknolojik olarak birbirini tamamlayan bu sistemlerle çok daha derin ve uygulanabilir bilgiler elde edebiliyor.”
Yeni Nesil İlaç Geliştirmeye Destek
Yapay zekâ teknolojileri, protein yapıları ve ilaç etkileşimlerini öngörerek ilaç keşfi sürecini hızlandırıyor; ancak bu tahminlerin işe yarar hale gelmesi için deneysel olarak doğrulanması gerekiyor. GenNext ve Thermo Fisher iş birliğiyle geliştirilen bu sistem, araştırmacıların yapay zekâ tarafından oluşturulan modelleri hızlı ve verimli bir şekilde test etmesini ve iyileştirmesini mümkün kılıyor — hatta bu yöntem, GenNext’in kendi araştırmaları ve müşterileri tarafından başarıyla kullanılmaya başlandı.
Hız, hassasiyet ve gerçek dünyaya uygun doğrulama yeteneğini bir araya getiren bu sistem, hem klasik hem de yapay zekâ destekli ilaç geliştirme süreçlerinde son derece güçlü bir çözüm olarak öne çıkıyor.
